عهد هشام المشيشي رئيس الحكومة لمحمد بوستة منصب مدعي عام في محكمة التعقيب ورئيس دائرة بمحكمة الاستئناف بتونس سنة 2012، كما شغل منصب رئيس المحكمة الابتدائية بمنوبة.
و في 2015 عيّن محمد بوستة وكيلا أولا للرئيس الأول لمحكمة الاستئناف بتونس و في 2019 عيّن رئيسا أولا لمحكمة الاستئناف ببنزرت.